유전형 분석(genotyping)은 염기서열의 정확한 위치를 특정하여 단편을 증폭하고 개체간의 변이를 확인하는 분석 방식입니다.
제이에스링크에서는 SNaPshot, Taqman, Fluidgim BioMark를 이용한 분석을 제공하고 있습니다.
WGS, GWAS 등에서 확보된 의미있는 마커를 대상으로 재현성(replication) 연구 시 활용할 수 있는 분석 방법 중 하나입니다.
제이에스링크는 다양한 SNP genotyping platform을 갖추고 있어 소량의 샘플부터 대량 샘플 분석까지 효율적인 분석이 가능합니다.
분석 Target SNP을 알려주시면 Primer Design부터 시작하여 최종 분석 결과를 제공 드립니다.
엄격한 Data QC과정을 통해 High Resolution, High Quality Data를 선별하여 신뢰도 높은 결과를 제공합니다.
연구 목적에 적합한 SNP 선정 후 샘플 수와 Design 가능 여부를 고려하여 Platform 선정합니다.
선정된 Platform에서 필요한 샘플 요구량에 맞춰서 샘플 준비. Whole blood나 Buffy coat 샘플은 추출부터 가능합니다.
SNP scoring : 기존 연구로 유의성이 밝혀진 SNP을 분석합니다.
SNP discovery : Novel한 SNP을 발굴하거나 알려진 SNP의 유무 및 frequency를 확인하는데 이용합니다.
Excel 형식으로 제공되며 SNP Discovery의 경우 Raw Data와 Annotation, LD 분석 결과도 함께 제공합니다.
| | Assay | Platform | Feature |
| Singleplex | SNaPshot assay | ABI 3730xl DNA Analyzer |
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| TaqMan assay | ABI PRISM 7900HT real-time PCR system |
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| Multiplex | SNPtype assay | Fluidigm BioMark™ System |
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* 분석 소요기간은 의뢰 당시의 일정에 따라 가감 될 수 있으므로 사전에 확인 하시기 바랍니다
・ HWE(Hardy-Weinberg Equilibrium) - Chi-square Test
・ Major, Minor allele
・ Allele frequency
・ HWE(Hardy-Weinberg Equilibrium)
・ Premutation Test Statistical Analysis
- Association Study
- Survival Analysis
- Student's t-Tests10
- ANOVA
- Regression Analysis
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